| 1.研究機関名 | 大阪医科大学 | |
| 2.研究領域 | 生命科学 | |
| 3.研究分野 | 生体分子の構造と機能調節(構造生物学と機能分子) | |
| 4.研究期間 | 平成8年度〜平成12年度 | |
| 5.研究プロジェクト番号 | 96L00506 | |
| 6.研究プロジェクト名 | 多機能性生体触媒の基質認識・触媒機能を支える立体的微細構造の動態に関する研究 |
| プロジェクト・リーダー名 | フリガナ | 所属部局名 | 職名 |
| 鏡山 博行 | カガミヤマ ヒロユキ | 医学部 | 教授 |
8.コア・メンバー
| コア・メンバー名 | フリガナ | 所属研究機関名・所属部局名 | 職名 |
| 林 秀行 | ハヤシ ヒデユキ | 大阪医科大学・医学部 | 助教授 |
9.研究協力者
| 研究協力者名 | フリガナ | 所属研究機関名・所属部局名 | 職名 |
| 広津 建 | ヒロツ ケン | 大阪市立大学大学院・理学研究科 | 教授 |
| 三浦 洌 | ミウラ レツ | 熊本大学・医学部 | 教授 |
| 虎谷 哲夫 | トラヤ テツオ | 岡山大学・工学部 | 教授 |
10.研究成果の概要
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ピリドキサール酵素10種、フラビン酵素2種、コバラミン酵素、キノ酵素、各1種のX線結晶解析を行い、基質認識や反応機構の精密解析を行って新しい知見を得ることが出来た。同じ基質に同じ反応を触媒する酵素でも、生物種が異なると基質認識に用いるアミノ酸残基は異なるが、認識に関する立体的な構造は共通していること、反応に直接関る部位は極めて“rigid”な構造で規制されているが、少し離れた基質の側鎖認識についてはある程度の“flexibility”が許されていること、それによってアミノ基転移酵素の場合、側鎖構造の大きく異なる基質の多重認識が可能になっていることが明らかになった。基質結合前には補酵素がエネルギーを蓄えた活性化状態にあり(補酵素と蛋白間のネジレ)、基質結合によってそれが解放されて反応の触媒効率や立体特異性を高めている機構が説明できた例、それを可能にしている酵素蛋白のコンホメーション変化の意味や、酵素・基質複合体内での補酵素の電子状態の変化から反応機構をうまく説明できた例、必ず通らなければならないと信じられていた反応中間体を通らない事が示された例など、古典的な酵素科学では達し得なかった新しい酵素学への道を拓いた。定向進化の手段によって、酵素の基質特異性の変換、熱安定性の獲得に成功。さらには、アポ蛋白として合成された後に、活性部位の構造の中で、特定のアミノ酸残基から補酵素が形成されるビルトイン補酵素の例につき、その過程を結晶解析像より説明した。 その他、アデノシルコバラミン補酵素が反応後に蛋白から外れるが、そこへ新しい補酵素を挿入して酵素を再活性化する蛋白質を発見、その遺伝子を同定した他、低温、高温という極限環境生物の酵素を数種クローニング、精製を行い、X線結晶解析を試みる段階まで来たものもあり今後の発展が期待される。 |
11.キーワード
(1)ピルドキサル酵素、(2)フラビン酵素、(3)コバラミン酵素
(4)ビルトイン酵素、(5)基質認識機構、(6)酵素反応機構
(7)X線結晶解析、(8)活性中心構築原理、(9)定向進化
12.研究発表(印刷中も含む)
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Ro, H. S. | Site-directed mutagenesis of the amino acid residues in β-strand III [Val30-Val36] of D-amino acid aminotransferase of Bacillus sp. YM-1 | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| FEBS Lett. | 398 | 1996 | 141-145 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Yoshimura, T. | Stereospecificity for the hydrogen transfer and molecular evolution of pyridoxal enzyme. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 60(2) | 1996 | 181-187 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Okamoto, A. | An aspartate aminotransferase from an extremely thermophilic bacterium, Thermus thermophilus HB8. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 119 | 1996 | 135-144 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Kato, R. | ATPase activity of UvrB protein from thermus thermophilus HB8, and its interaction with DNA. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 271 | 1996 | 9612-9618 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Yamamoto, N. | Cloning sequencing expression of the UvrA gene from an extremely thermophilic bacterium, Thermus thermophilus HB8. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Gene | 171 | 1996 | 103-106 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mizutani, H. | Three-dimensional structure of porcine kidney D-amino acid oxidase at 3.0 Å. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 120 | 1996 | 14-17 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Setoyama, C. | Crystallization of expressed porcine kidnet D-amino acid oxidase and preliminary X-ray crystallographic characterzation. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 119 | 1996 | 1114-1117 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nakamura, N. | Biosynthesis of Topa quinone cofactor in bacterial amino oxidases. Solvent origin of C-2 oxygen determined by Raman spectroscopy. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 271 | 1996 | ||
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Choi, Y. H. | Role of conserver Asn-Tyr-Asp-Tyr sequence in bactenal copper / 2,4,5- Trihydroxyphenylalany Quinone-containing histamine oxidase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 271 | 1996 | 22598-22603 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Tobimatsu, T. | Cloning, sequencing and high-level expression of the genes encoding adenosylcobalamin-dependent glycerol dehydrase of Klebsiella pneumoniae. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 271 | 1996 | 22352-22357 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Hayashi, H. | Analysis of the substrate recognition mode of aromatic amino acid aminotransferase by combined use of quasisubstrates and site-directed mutagenesis. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 35 | 1996 | 6754-6761 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Ishii, S. | Functionally important residues of aromatic L-amino acid decarboxylase probed by sequence alignment and site-directed mutagenesis. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 120 | 1996 | 369-376 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nakai, Y. | Cloning and characterization of the TyrB gene from Salmonella typhimurium. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochim. biophys. Acta. | 1308 | 1996 | 189-192 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mollova, E. T. | Use of 1H-15Nheteronuclear multiple-quantum coherence NMR spectroscopy to study the active site of aspartate aminotransferase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistyr. | 36 | 1997 | 615-625 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mur, M. | Chemical and biochemical characteristics of Topa quinone. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 61 | 1997 | 410-417 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Ruggiero, C. E. | Mechanistic studies of Topa quinone biogenesis in phenylethylamine oxidase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 36 | 1997 | 1953-1959 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Toraya, T. | An electron paramagnetic resonance study on the mechanism-based inactivation of adenosylcobalamin-dependent diol dehydrase by glycerol and other substrates. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochim. Biophys. Acta. | 1337 | 1997 | 11-16 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oue, S. | Paracoccus denitrificans aromatic amino acid aminotransferase: A model enzyme for the study of dual substrate recognition mechanism. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 121 | 1997 | 161-171 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Galkin, A. | Conversion of α-keto acid to D-amino acid by coupling of four enzyme reactions. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Ferment. Bioeng. | 83 | 1997 | 299-300 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Hayashi, H. | Transient - state kinetics of the reaction of aspartate aminotransferase with aspartate at low pH reveals dual routes in the enzyme - substrate association process. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biocnemistry | 36 | 1997 | 13558-13569 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Hazekawa, I | A Raman study on the C(4)=0 stretching mode of flavins in flavoenzymes: Hydrogen bonding at the C(4)=0 moiety. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 121 | 1997 | 1147-1154 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Kawaguchi, S. | Enzyme flexibility: New concept in recognition of hydrophobic substrates. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 122 | 1997 | 55-63 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Kishimoto, K. | Mutation of Arg98, which serves as a substrate - recognition site of D-amino acid aminotransferase, can be partly compensated for by mutation of Tyr88 to an argrinine residue | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 122 | 1997 | 1182-1189 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mihara, H. | Cysteine sulfinate desulfinase, a NIFS like protein of Escherichia coli with selenocysteine lyase and cysteine desulfurase activities | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 272 | 1997 | 22417-22424 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Miura, R. | Structural and mechanistic studies on D-amino acid oxidase - substrate complex: Implications of the crystal structure of enzyme - substrate analog complex. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 122 | 1997 | 825-833 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mori, K. | A protein factor is essential for in situ reactivation of glycerol- inactivated adenosylcobalamin-dependent diol dehydrase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 61 | 1997 | 1729-1733 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mori, K. | Characterization, sequencing and expression of the genes encoding a reactivating factor for glycerol - inactivated adenosylcobalamin - degendent diol dehydratase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 272 | 1997 | 32034-32041 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mure, M. | Chemical and biochemical characteristics of topaquinone. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 61 | 1997 | 410-417 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nakamura, N. | Topaquinone - dependent amine oxidase. Identification of reaction intermediates by Raman spectroscopy. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 36 | 1997 | 11479-11486 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nishino, J. | An anomalous side reaction of the Lys303 mutant aromatic - L - amino acid decarboxylase unravels the role of the residue in catalysis. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 121 | 1997 | 604-611 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oikawa, T. | A novel of D - mannitol dehydrogenase from Acetobacter xylinum : Occurrence, purification, and basic properties | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 61 | 1997 | 1778-1782 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Okada, K. | Three - dimensional structure of Escherichia coli branched - chain amino acid aminotransferase at 2.5 Å resolution. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 121 | 1997 | 637-641 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Ruggiero, C. E. | Mechanistic studis of topa quinone biogenesis in phenylethylamine oxidase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 36 | 1997 | 1953-1958 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Setoyama, C. | Structural and functional characterization of the fuman brain D - aspartate oxidase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 121 | 1997 | 798-803 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Shimizu, E. | Purification and properties of phenylethylamine oxidase of Arthrobacter globiformis. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 61 | 1997 | 501-505 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Tamaoki, H. | Spectroscopic studies of rat liver acyl - CoA oxidase with reference to recognition and activation of substrate. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 121 | 1997 | 1139-1146 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Tobimatsu, T. | Heterologous expression, purification and properties of diol dehydratase, an adenosylcobalanin - dependent enzyme of Klebsiella oxytoca. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Arch. Biochem. Biophys. | 347 | 1997 | 132-140 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| 谷澤 克行 | 銅アミンオキシダーゼにおけるトパキノン補酵素生成のしくみ | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| 化学と生物 | 35 | 1997 | 569-575 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| 虎谷 哲夫 | ビタミンB12酵素研究の新局面 | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| 生化学 | 69 | 1997 | 1281-1287 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Wilce, M. C. | Crystal structures of the copper - containing amine oxidase from Arthrobacter globiformis in the holo - and apo - forms: Implications for the biogenesis of topa quinone. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 36 | 1997 | 16116-16133 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Yamada, K. | Purification and some properties of cobalamin - dependent methionine synthase from rat liver. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Nutr. Sci. Vitaminol. | 43 | 1997 | 177-186 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Ikushiro, H. | Analysis of the pH - and ligand - induced spectral transitions of tryptophanase : Activation of the coenzyme at the early steps of the catalytic cycle. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 37 | 1998 | 3043-3052 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Lim, Y. H. | Non-stereospecific transamination catalyzed by pyridoxal - dependent amino acid racemases of broad substrate specificity. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 273 | 1998 | 4001-4005 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Liu, L. | Compensation for D-glutamate auxotrophy of IWM335 by D-amino acid aminotransferase gene and regulation of murl expression. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 62 | 1998 | 193-195 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Gutierrez, A. | A mutant D-amino acid aminotransferase with broad specificity: Construction by replacement of the interdomain loop Pro119 - Arg120 - Pro121 by Gly - Gly -Gly. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Protein Engineering. | 11(1) | 1998 | 53-58 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Yamada, K. | Cloning, Sequencing, and Heterologous Expression of Rat Methionine Synthase cDNA. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 61 | 1998 | 2155-2160 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Yamanishi, M. | EPR Spectroscopic Evidence for the Mechanism-based Inactivation of Adenosylcobalamin-dependent Diol Dehydratase by Coenzyme Analogs. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 124 | 1998 | 598-601 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Tobimatsu, T. | Molecular Cloning, Sequencing and Characterization of the Genes for Adenosylcobalamin-dependent Diol Dehydratase of Klebsiella pneumoniae. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 62 | 1998 | 1774-1777 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Yamanishi, M. | Evidence for Axial Coordination of 5,6-Dimethylbenzimidazole to the Cobalt Atom of Adenosylcobalamin Bound to Diol Dehydratase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 37 | 1998 | 4799-4803 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Kawaguchi, S. | Thermodynamics and Molecular Simulation Analysis of Hydrophobic Substrate Recognition by Aminotransferases. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 273 | 1998 | 18353-18364 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nakai, T. | Crystallization and Preliminary X-ray Characterization of Aspartate Aminotransferase from an Extreme Thermophile, Thermus thermophilus HB. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Acta Crystallogr. | D54(5) | 1998 | 1032-1034 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Okamoto, A. | Crystal Structures of Paracoccus denitrificans Aromatic Amino Acid Aminotransferase: A Substrate Recognition Site Constructed by Rearrangement of Hydrogen Bond Network. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Mol. Biol. | 280 | 1998 | 443-461 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nobe, Y. | The Novel Substrate Recognition Mechanism Utilized by Aspartate Aminoransferase of the Extreme Thermophile Thermus thermophilus HB8. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 273 | 1998 | 29554-29564 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oikawa, T. | Endo- β -Glucanase Secreted by a Psychrotrophic Yeast: Purification and Characterization. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 62 | 1998 | 1751-1756 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Yano, T. | Directed Evolution of An Aspartate Aminotransferase With New Substrate Specificities. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Proc. Natl. Acad. Sci. USA | 95 | 1998 | 5511-5515 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Ishii, S. | Aromatic L-Amino Acid Decarboxylase: Conformational Change in The Flexible Region Around Arg334 Is Reguired During The Transaldimination Process. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Protein Sci. | 7 | 1998 | 1802-1810 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Hayashi, H. | The Imine-Pyridine Torsion of The Pyridoxal 5'-Phosphate Schiff Base of Aspartate Aminotransferase Lowers Its pKa in The Unliganded Enzyme And Is Crucial For The Successive in The pKa During Catalysis. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 37 | 1998 | 15076-15085 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Li, Y.-F. | Crystal Structures of Reaction Intermediates of L-2-Haloacid Dehalogenase And Implications for The Reaction Mechanism. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 273 | 1998 | 15035-15044 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Sugio, S. | Crystal Structures of L201A Mutant of D-Amino Acid Aminotransferase at 2.0 A Resolution: Implication of Structural Role of Leu201 in Transamination. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Protein Engineering | 11 | 1998 | 613-619 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Uo, T. | Occurrence Of Pyridoxal 5'-Phosphate-Dependent Serine Racemase in Silkworm, Bombyx mori. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochem. Biophys. Res. Commun. | 246 | 1998 | 31-34 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Fuchikami, Y. | Construction and Properties of a Fragmentary D-Amino Acid Aminotransferase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 124 | 1998 | 905-910 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Kurokawa, Y. | Transamination as a Side-Reaction Catalyzed by Alanine Racemase of Bacillus stearothemophilus. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 124 | 1998 | 1163-1169 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Li, Y. -F | X-Ray Structure of A Reaction Intermediate of L-2-Haloacid Dehalogenase with L-2-Chloropropionamide. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 124 | 1998 | 20-22 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nishina, Y. | Resonance Raman Study on Reduced Flavin in Purple Intermediate of Flavoenzyme: Use of [4-Carbonyl-18O]-Enriched Flavin. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 124 | 1998 | 200-208 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Matsuzaki, R. | Exploring A Channel to The Active Site of Copper / Topaquinone-Containing Phenylethylamine Oxidase by Chemical. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 37 | 1998 | 13947-13957 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oue, S. | Redesignning The Substrate Specificity of An Enzyme by Cumulative Effects of The Mutations of Non-Active Site Residues. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 274 | 1999 | 2344-2349 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Toraya, T. | A Reactivating Factor for Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 247 | 1999 | 3372-3377 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Watanabe, A. | Role of Lysine39 of Alanine Racemase from Bacillus Stearothermophilus That Binds Pyridoxal 5'-Phosphate:Chemical Rescue Studies of Lys39→Ala Mutant. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 247 | 1999 | 4189-4194 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Tamaoki, H. | Mechanism for Recognition and Activation of Substrate in Medium-Chain Acyl-CoA Dehydrogenase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 125 | 1999 | 285-296 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Odagaki, Y. | Crystal Structure of The Pyroglutamyl Peptidase I from Bacillus amyloliquefaciens Reveals New Structure for A Cysteine Protease | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Structure | 7 | 1999 | 399-411 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Galkin, A. | Cold-Adapted Alanine Dehydrogenases from Two Antarctic Bacterial Strains: Gene Cloning. Protein Characterization, and Comparison with Mesophilic and Thermophilic Counterparts. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Appl. Environ. Microbiol. | 65(9) | 1999 | 4014-4020 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mihara, H. | AnifS-like Gene, csdB, Encodes an Escherichia coli Counterpart of Mammalian Selenocysteine Lyase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 274(21) | 1999 | 14768-14772 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Watanabe, A. | Tyrosine 265 of Alanine Racemase Serves as a Base Abstracting a-Hydrogen from L-Alanine: The Counterpart Residue to Lysine 39 Specific to D-Alanine. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 126(4) | 1999 | 781-786 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Tamaoki, H. | Mechanism for recognition and activation of substrate in medium-chain acyl-CoA dehydrogenase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 125 | 1999 | 285-296 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Hirota, S. | Spectroscopic Characterzation of Carbon Monoxide Complexes Generated for Copper/Topa Quinone-Containing Amine Oxidases. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 38 | 1999 | 14256-14263 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| 谷澤 克行 | ビルトイン補酵素−アミノ酸残基に由来する新しい補酵素− | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| 蛋白質核酸酵素 | 44 | 1999 | 1947-1958 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Yamada, K. | Heterologous High-level Expression, Purification, and Enzymological Properties of Recombinant Rat Cobalamin-dependent Methionine Synthase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 274 | 1999 | 35571-35576 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mori, K. | The Mechanism of Reactivation of Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase by a Molecular Chaperone-Like Reactivating Factor. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 38 | 1999 | 13170-13178 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Toraya, T. | Direct Participaton of Potassium Ion in the Catalysis of Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 126 | 1999 | 650-654 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Masuda, J. | Crystallization and Preliminary X-ray Study of Two Crystal Forms of Klebsiella oxytoca Diol Dehydratase-cyanocobalamin Complex. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Acta. Crystallogr. | D55 | 1999 | 907-909 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Shibata, N. | A New Mode of B12 Binding and the Direct Particpation of a Potassium Ion in Enzyme Catalysis. X-ray Structure of Diol Dehydratase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Structure | 7 | 1999 | 997-1008 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Tobimatsu, T. | Identification and Expression of the Genes Encoding a Reactivating Factor for Adenosylcobalamin-dependent Glycerol Dehydratase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Bacter. | 181 | 1999 | 4410-4113 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oikawa, T. | Production of D-Glutamate from L-Glutamate with Glutamate Racemase and L-Glutamate Oxidase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 63 | 1999 | 2168-2173 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oikawa, T. | Stereoisomers of Glutathione: Preparation and Enzymatic Reactivities. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Nutr. Sci. Vitaminol. | 45 | 1999 | 223-229 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nakai, T. | Structure of Thermus thermophilus HB8 Aspartate Aminotransferase and Its Complex with Maleate. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 38(8) | 1999 | 2413-2424 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Hoseki, J. | Directed Evolution of Thermostable Kanamycin-Resistant Gene Products in an Extremely Thermophilic Bacterium, Thermus thermophilus. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 126(5) | 1999 | 951-956 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Hayashi, H. | Acid-Base Chemistry of the Reaction. of Aromatic L-Amino Acid Decarboxylase and Dopa Analyzed by Transient and Steady-State Kinetics: Preferential Binding of the Substrate with Its Amino Group Unprotonated. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 38 | 1999 | 15615-15622 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oue, S. | Cocrystallization of a Mutant Aspartate Aminotransferase with a C5-Dicarboxylic Substrate Analog: Structural Comparison with the Enzyme-C4-Dicarboxylic Analog Complex. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 127 | 2000 | 337-343 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Koyanagi, T. | Molecular Cloning snd Heterologous Expression of Pea Seedling Copper Amine Oxidase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biosci. Biotech. Biochem. | 64 | 2000 | 717-722 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mihara, H. | Kinetic and mutational studies of three Nifs homologs from Escherichia coli : Mechanistic difference between L-cysteine desulfurase and L-selenocysteine lyase reactions. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 127(2) | 2000 | 559-567 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mihara, H. | cDNA cloning, purification, and characterization of mouse liver selenocysteine lyase. Condidate for selenium delivery protein in selenoprotein synthesis. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 275(9) | 2000 | 6195-6200 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Fujii, T. | Structure of Nifs homologue: X-ray structure analysis of Csd B, an Escherichia coli counterpart of mammalian selenocysteine lyase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 39(6) | 2000 | 1263-1273 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Gutierrez, A. | Modulation of activity and substrate specificity by modifying the backbone length of the distant interdomain loop of D-amino acid aminotransferase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Eur. J. Biochem. | 267(24) | 2000 | 7218-7223 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nakai, T. | Three dimensional structure of 4-amino-4-deoxychorismate lyase from Escherichia coli. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 128 | 2000 | 29-38 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Ishijima, J. | Free energy requirement for domain movement of enzyme. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 275(25) | 2000 | 18939-18945 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Matsui, I. | The molecular structure of hyperthermostable aromatic aminotransferase with novel substrate specificity from Pyrococcus horikoshii. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biol. Chem. | 275(7) | 2000 | 4871-4879 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mizutani, H. | Three-dimensional structure of the purple intermediate of porcine kidney D-amino acid oxidase. Optimization of the oxidative half-reaction through alignment of the product with reduced flavin. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 128 | 2000 | 73-81 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Toraya, T. | Radical atalysis of B12 enzymes: structure, mechanism, inactivation and reactivation of diol and glycerol dehydratasesm. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Cell. Mol. Life Sci. | 57 | 2000 | 106-127 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Masuda, J. | How a grotein generates a catalytic radical from coenzyme B12 : X-ray structure of a diol - dehydratase - adeninylpentylcobalamin Complex. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Structure | 8 | 2000 | 775-788 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Tobimatsu, T. | Specificities of reactivating factors for adenosylcoblamin - dependent diol dehydratase and glycerol dehydratase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Arch. Microbiol. | 174 | 2000 | 81-88 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Nishina, Y. | Substrate recognition and activation mechanism of D-amino acid oxidase : A study using substrate analogs. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 128 | 2000 | 213-223 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| M. M. Islam | The substrate activation process in the catalytic reaction of Escherichia coli aromatic amino acid aminotransferase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 39(50) | 2000 | 15418-15428 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| 鏡山 博行 | 立体構造をもとにしたトランスアミナーゼの研究 | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| ビタミン | 74(1) | 2000 | 1-12 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Ura, H. | Temperature dependence of the enzyme - substrate recognition mechanism. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 129(1) | 2001 | 173-178 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Mizuguchi, H. | Strain is more important than electrostatic interaction in controlling the pKa of the catalytic group in aspatate aminotransferase. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 40 | 2001 | 353-360 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Miura, R. | Porcine kidney D-amino acid oxidase : The three dimensional structure and its catalytic mechanism based on the enzyme - substrate complex model. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Mol. Catalysis. B, Enzymatic | 12 | 2001 | 43-52 | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Haruyama, K. | Structure of Escherichia coli histidinol - phosphate aminotransferase and its complexes with histidinol - phosphate and N-(5'-phosphopyridoxyl)-L-glutamate double substrate recognition of the enzyme | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochemistry | 40 | 2001 | in press | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Miura, R. | Versatility and specificity of flavoenzymes : Control mechanism of flavin reactivity. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| The Chemical Record | 1 | 2001 | in press | |
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Watanabe, A. | Stereochemistry of the hydrogen abstraction from pyridoxamine phosphate catalyzed by alanine racemase of Bacillus stearothermophilus. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Mol. Catalysis | 2001 | in press | ||
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Eda, M. | Theoretical Predictions on the Mechanism of Catalysis of Coenzyme B12 - Dependent Diol. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Dehydratase | 2001 | in press | ||
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oikawa, T. | Fragmentary form of thermostable leucine dehydrogenase of Bacillus stearothermophilus: Its construction and reconstruction of active fragmentary enzyme. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Biochem. Biophys. Res. Commun | 2001 | in press | ||
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oikawa, T. | Alanine aminotransferase II from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus sp. TK1: Purification, molecular characterization, and expression in Escherichia coli. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Eur, J. Biochem. | 2001 | in press | ||
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oikawa, T. | Psychrophilic valine dehydrogenase of Antarctic Psychophile, Cytophaga sp. P1: Purification, molecular characterization, and expression in Escherichia coli. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Eur. J. Biochem. | 2001 | |||
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Kazuoka, T. | Thermostable alcohol dehydrogenase from a Psycophile, Cytophage sp. KUC-1: Cloning, molecular characterization. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Proc. Natl. Acad. Sci. USA | 2001 | in press | ||
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Oikawa, T | Alanine aminotransferase I from the hyperthermophilic Archaeon Thermococcus sp. TK1: Purification, molecular characterization, and expression in Escherichia coli. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| Eur. J. Biochem. | 2001 | in press | ||
| 著者名 | 論文標題 | |||
| Jhee, K. -H. | Stereochemistry of the transamination reaction catalyzed by aminodeoxychorismate lyase from Escherichia coli: Close relationship between fold type and stereochemistry. | |||
| 雑誌名 | 巻 | 発行年 | ページ | |
| J. Biochem. | 128(4) | 2000 | 679-686 | |
| 著者名 | 出版者 | ||
| Miura, R. | Agency for Scientific Publ., Berlin. | ||
| 書名 | 発行年 | 総ページ数 | |
| Flavins and Flavoproteins | 1999 | 939 | |
| 著者名 | 出版者 | ||
| Setoyama, C. | Agency for Scientific Publ., Berlin. | ||
| 書名 | 発行年 | 総ページ数 | |
| Flavins and Flavoproteins | 1999 | 939 | |
| 著者名 | 出版者 | ||
| Kagamiyama, H. | Academic Press | ||
| 書名 | 発行年 | 総ページ数 | |
| Methodes in Enzymology (Branched. chain amino acid aminotransferase in E. coli) | 2000 | 550 | |
| 著者名 | 出版者 | ||
| Hayashi, H. | Birkhauser Verlag | ||
| 書名 | 発行年 | 総ページ数 | |
| Biochemistry and Molecular Bioligy of Vitamin B6 and PQQ - dependent proteins | 2000 | 376 | |
| 著者名 | 出版者 | ||
| Hirotsu, K. | Birkhauser Verlag | ||
| 書名 | 発行年 | 総ページ数 | |
| Biochemistry and Molecular Biology of Vitamin B6 and PQQ - dependent proteins. | 2000 | 376 | |