平成12年度未来開拓学術研究推進事業研究成果報告書概要



1.研究機関名 大阪医科大学
 
2.研究領域 生命科学
 
3.研究分野 生体分子の構造と機能調節(構造生物学と機能分子)
 
4.研究期間 平成8年度〜平成12年度
 
5.研究プロジェクト番号 96L00506
 
6.研究プロジェクト名 多機能性生体触媒の基質認識・触媒機能を支える立体的微細構造の動態に関する研究

7.プロジェクト・リーダー
プロジェクト・リーダー名 フリガナ 所属部局名 職名
鏡山 博行 カガミヤマ ヒロユキ 医学部 教授

8.コア・メンバー

コア・メンバー名 フリガナ 所属研究機関名・所属部局名 職名
林 秀行 ハヤシ ヒデユキ 大阪医科大学・医学部 助教授

9.研究協力者

研究協力者名 フリガナ 所属研究機関名・所属部局名 職名
広津 建 ヒロツ ケン 大阪市立大学大学院・理学研究科 教授
三浦 洌 ミウラ レツ 熊本大学・医学部 教授
虎谷 哲夫 トラヤ テツオ 岡山大学・工学部 教授

10.研究成果の概要

ピリドキサール酵素10種、フラビン酵素2種、コバラミン酵素、キノ酵素、各1種のX線結晶解析を行い、基質認識や反応機構の精密解析を行って新しい知見を得ることが出来た。同じ基質に同じ反応を触媒する酵素でも、生物種が異なると基質認識に用いるアミノ酸残基は異なるが、認識に関する立体的な構造は共通していること、反応に直接関る部位は極めて“rigid”な構造で規制されているが、少し離れた基質の側鎖認識についてはある程度の“flexibility”が許されていること、それによってアミノ基転移酵素の場合、側鎖構造の大きく異なる基質の多重認識が可能になっていることが明らかになった。基質結合前には補酵素がエネルギーを蓄えた活性化状態にあり(補酵素と蛋白間のネジレ)、基質結合によってそれが解放されて反応の触媒効率や立体特異性を高めている機構が説明できた例、それを可能にしている酵素蛋白のコンホメーション変化の意味や、酵素・基質複合体内での補酵素の電子状態の変化から反応機構をうまく説明できた例、必ず通らなければならないと信じられていた反応中間体を通らない事が示された例など、古典的な酵素科学では達し得なかった新しい酵素学への道を拓いた。定向進化の手段によって、酵素の基質特異性の変換、熱安定性の獲得に成功。さらには、アポ蛋白として合成された後に、活性部位の構造の中で、特定のアミノ酸残基から補酵素が形成されるビルトイン補酵素の例につき、その過程を結晶解析像より説明した。
その他、アデノシルコバラミン補酵素が反応後に蛋白から外れるが、そこへ新しい補酵素を挿入して酵素を再活性化する蛋白質を発見、その遺伝子を同定した他、低温、高温という極限環境生物の酵素を数種クローニング、精製を行い、X線結晶解析を試みる段階まで来たものもあり今後の発展が期待される。

11.キーワード

(1)ピルドキサル酵素、(2)フラビン酵素、(3)コバラミン酵素
(4)ビルトイン酵素、(5)基質認識機構、(6)酵素反応機構
(7)X線結晶解析、(8)活性中心構築原理、(9)定向進化

12.研究発表(印刷中も含む)

[雑誌論文]
著者名 論文標題
Ro, H. S. Site-directed mutagenesis of the amino acid residues in β-strand III [Val30-Val36] of D-amino acid aminotransferase of Bacillus sp. YM-1
雑誌名 発行年 ページ
FEBS Lett. 398 1996 141-145

著者名 論文標題
Yoshimura, T. Stereospecificity for the hydrogen transfer and molecular evolution of pyridoxal enzyme.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 60(2) 1996 181-187

著者名 論文標題
Okamoto, A. An aspartate aminotransferase from an extremely thermophilic bacterium, Thermus thermophilus HB8.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 119 1996 135-144

著者名 論文標題
Kato, R. ATPase activity of UvrB protein from thermus thermophilus HB8, and its interaction with DNA.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 271 1996 9612-9618

著者名 論文標題
Yamamoto, N. Cloning sequencing expression of the UvrA gene from an extremely thermophilic bacterium, Thermus thermophilus HB8.
雑誌名 発行年 ページ
Gene 171 1996 103-106

著者名 論文標題
Mizutani, H. Three-dimensional structure of porcine kidney D-amino acid oxidase at 3.0 Å.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 120 1996 14-17

著者名 論文標題
Setoyama, C. Crystallization of expressed porcine kidnet D-amino acid oxidase and preliminary X-ray crystallographic characterzation.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 119 1996 1114-1117

著者名 論文標題
Nakamura, N. Biosynthesis of Topa quinone cofactor in bacterial amino oxidases. Solvent origin of C-2 oxygen determined by Raman spectroscopy.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 271 1996  

著者名 論文標題
Choi, Y. H. Role of conserver Asn-Tyr-Asp-Tyr sequence in bactenal copper / 2,4,5- Trihydroxyphenylalany Quinone-containing histamine oxidase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 271 1996 22598-22603

著者名 論文標題
Tobimatsu, T. Cloning, sequencing and high-level expression of the genes encoding adenosylcobalamin-dependent glycerol dehydrase of Klebsiella pneumoniae.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 271 1996 22352-22357

著者名 論文標題
Hayashi, H. Analysis of the substrate recognition mode of aromatic amino acid aminotransferase by combined use of quasisubstrates and site-directed mutagenesis.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 35 1996 6754-6761

著者名 論文標題
Ishii, S. Functionally important residues of aromatic L-amino acid decarboxylase probed by sequence alignment and site-directed mutagenesis.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 120 1996 369-376

著者名 論文標題
Nakai, Y. Cloning and characterization of the TyrB gene from Salmonella typhimurium.
雑誌名 発行年 ページ
Biochim. biophys. Acta. 1308 1996 189-192

著者名 論文標題
Mollova, E. T. Use of 1H-15Nheteronuclear multiple-quantum coherence NMR spectroscopy to study the active site of aspartate aminotransferase.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistyr. 36 1997 615-625

著者名 論文標題
Mur, M. Chemical and biochemical characteristics of Topa quinone.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 61 1997 410-417

著者名 論文標題
Ruggiero, C. E. Mechanistic studies of Topa quinone biogenesis in phenylethylamine oxidase.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 36 1997 1953-1959

著者名 論文標題
Toraya, T. An electron paramagnetic resonance study on the mechanism-based inactivation of adenosylcobalamin-dependent diol dehydrase by glycerol and other substrates.
雑誌名 発行年 ページ
Biochim. Biophys. Acta. 1337 1997 11-16

著者名 論文標題
Oue, S. Paracoccus denitrificans aromatic amino acid aminotransferase: A model enzyme for the study of dual substrate recognition mechanism.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 121 1997 161-171

著者名 論文標題
Galkin, A. Conversion of α-keto acid to D-amino acid by coupling of four enzyme reactions.
雑誌名 発行年 ページ
J. Ferment. Bioeng. 83 1997 299-300

著者名 論文標題
Hayashi, H. Transient - state kinetics of the reaction of aspartate aminotransferase with aspartate at low pH reveals dual routes in the enzyme - substrate association process.
雑誌名 発行年 ページ
Biocnemistry 36 1997 13558-13569

著者名 論文標題
Hazekawa, I A Raman study on the C(4)=0 stretching mode of flavins in flavoenzymes: Hydrogen bonding at the C(4)=0 moiety.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 121 1997 1147-1154

著者名 論文標題
Kawaguchi, S. Enzyme flexibility: New concept in recognition of hydrophobic substrates.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 122 1997 55-63

著者名 論文標題
Kishimoto, K. Mutation of Arg98, which serves as a substrate - recognition site of D-amino acid aminotransferase, can be partly compensated for by mutation of Tyr88 to an argrinine residue
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 122 1997 1182-1189

著者名 論文標題
Mihara, H. Cysteine sulfinate desulfinase, a NIFS like protein of Escherichia coli with selenocysteine lyase and cysteine desulfurase activities
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 272 1997 22417-22424

著者名 論文標題
Miura, R. Structural and mechanistic studies on D-amino acid oxidase - substrate complex: Implications of the crystal structure of enzyme - substrate analog complex.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 122 1997 825-833

著者名 論文標題
Mori, K. A protein factor is essential for in situ reactivation of glycerol- inactivated adenosylcobalamin-dependent diol dehydrase.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 61 1997 1729-1733

著者名 論文標題
Mori, K. Characterization, sequencing and expression of the genes encoding a reactivating factor for glycerol - inactivated adenosylcobalamin - degendent diol dehydratase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 272 1997 32034-32041

著者名 論文標題
Mure, M. Chemical and biochemical characteristics of topaquinone.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 61 1997 410-417

著者名 論文標題
Nakamura, N. Topaquinone - dependent amine oxidase. Identification of reaction intermediates by Raman spectroscopy.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 36 1997 11479-11486

著者名 論文標題
Nishino, J. An anomalous side reaction of the Lys303 mutant aromatic - L - amino acid decarboxylase unravels the role of the residue in catalysis.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 121 1997 604-611

著者名 論文標題
Oikawa, T. A novel of D - mannitol dehydrogenase from Acetobacter xylinum : Occurrence, purification, and basic properties
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 61 1997 1778-1782

著者名 論文標題
Okada, K. Three - dimensional structure of Escherichia coli branched - chain amino acid aminotransferase at 2.5 Å resolution.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 121 1997 637-641

著者名 論文標題
Ruggiero, C. E. Mechanistic studis of topa quinone biogenesis in phenylethylamine oxidase.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 36 1997 1953-1958

著者名 論文標題
Setoyama, C. Structural and functional characterization of the fuman brain D - aspartate oxidase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 121 1997 798-803

著者名 論文標題
Shimizu, E. Purification and properties of phenylethylamine oxidase of Arthrobacter globiformis.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 61 1997 501-505

著者名 論文標題
Tamaoki, H. Spectroscopic studies of rat liver acyl - CoA oxidase with reference to recognition and activation of substrate.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 121 1997 1139-1146

著者名 論文標題
Tobimatsu, T. Heterologous expression, purification and properties of diol dehydratase, an adenosylcobalanin - dependent enzyme of Klebsiella oxytoca.
雑誌名 発行年 ページ
Arch. Biochem. Biophys. 347 1997 132-140

著者名 論文標題
谷澤 克行 銅アミンオキシダーゼにおけるトパキノン補酵素生成のしくみ
雑誌名 発行年 ページ
化学と生物 35 1997 569-575

著者名 論文標題
虎谷 哲夫 ビタミンB12酵素研究の新局面
雑誌名 発行年 ページ
生化学 69 1997 1281-1287

著者名 論文標題
Wilce, M. C. Crystal structures of the copper - containing amine oxidase from Arthrobacter globiformis in the holo - and apo - forms: Implications for the biogenesis of topa quinone.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 36 1997 16116-16133

著者名 論文標題
Yamada, K. Purification and some properties of cobalamin - dependent methionine synthase from rat liver.
雑誌名 発行年 ページ
J. Nutr. Sci. Vitaminol. 43 1997 177-186

著者名 論文標題
Ikushiro, H. Analysis of the pH - and ligand - induced spectral transitions of tryptophanase : Activation of the coenzyme at the early steps of the catalytic cycle.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 37 1998 3043-3052

著者名 論文標題
Lim, Y. H. Non-stereospecific transamination catalyzed by pyridoxal - dependent amino acid racemases of broad substrate specificity.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 273 1998 4001-4005

著者名 論文標題
Liu, L. Compensation for D-glutamate auxotrophy of IWM335 by D-amino acid aminotransferase gene and regulation of murl expression.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 62 1998 193-195

著者名 論文標題
Gutierrez, A. A mutant D-amino acid aminotransferase with broad specificity: Construction by replacement of the interdomain loop Pro119 - Arg120 - Pro121 by Gly - Gly -Gly.
雑誌名 発行年 ページ
Protein Engineering. 11(1) 1998 53-58

著者名 論文標題
Yamada, K. Cloning, Sequencing, and Heterologous Expression of Rat Methionine Synthase cDNA.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 61 1998 2155-2160

著者名 論文標題
Yamanishi, M. EPR Spectroscopic Evidence for the Mechanism-based Inactivation of Adenosylcobalamin-dependent Diol Dehydratase by Coenzyme Analogs.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 124 1998 598-601

著者名 論文標題
Tobimatsu, T. Molecular Cloning, Sequencing and Characterization of the Genes for Adenosylcobalamin-dependent Diol Dehydratase of Klebsiella pneumoniae.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 62 1998 1774-1777

著者名 論文標題
Yamanishi, M. Evidence for Axial Coordination of 5,6-Dimethylbenzimidazole to the Cobalt Atom of Adenosylcobalamin Bound to Diol Dehydratase.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 37 1998 4799-4803

著者名 論文標題
Kawaguchi, S. Thermodynamics and Molecular Simulation Analysis of Hydrophobic Substrate Recognition by Aminotransferases.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 273 1998 18353-18364

著者名 論文標題
Nakai, T. Crystallization and Preliminary X-ray Characterization of Aspartate Aminotransferase from an Extreme Thermophile, Thermus thermophilus HB.
雑誌名 発行年 ページ
Acta Crystallogr. D54(5) 1998 1032-1034

著者名 論文標題
Okamoto, A. Crystal Structures of Paracoccus denitrificans Aromatic Amino Acid Aminotransferase: A Substrate Recognition Site Constructed by Rearrangement of Hydrogen Bond Network.
雑誌名 発行年 ページ
J. Mol. Biol. 280 1998 443-461

著者名 論文標題
Nobe, Y. The Novel Substrate Recognition Mechanism Utilized by Aspartate Aminoransferase of the Extreme Thermophile Thermus thermophilus HB8.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 273 1998 29554-29564

著者名 論文標題
Oikawa, T. Endo- β -Glucanase Secreted by a Psychrotrophic Yeast: Purification and Characterization.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 62 1998 1751-1756

著者名 論文標題
Yano, T. Directed Evolution of An Aspartate Aminotransferase With New Substrate Specificities.
雑誌名 発行年 ページ
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 1998 5511-5515

著者名 論文標題
Ishii, S. Aromatic L-Amino Acid Decarboxylase: Conformational Change in The Flexible Region Around Arg334 Is Reguired During The Transaldimination Process.
雑誌名 発行年 ページ
Protein Sci. 7 1998 1802-1810

著者名 論文標題
Hayashi, H. The Imine-Pyridine Torsion of The Pyridoxal 5'-Phosphate Schiff Base of Aspartate Aminotransferase Lowers Its pKa in The Unliganded Enzyme And Is Crucial For The Successive in The pKa During Catalysis.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 37 1998 15076-15085

著者名 論文標題
Li, Y.-F. Crystal Structures of Reaction Intermediates of L-2-Haloacid Dehalogenase And Implications for The Reaction Mechanism.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 273 1998 15035-15044

著者名 論文標題
Sugio, S. Crystal Structures of L201A Mutant of D-Amino Acid Aminotransferase at 2.0 A Resolution: Implication of Structural Role of Leu201 in Transamination.
雑誌名 発行年 ページ
Protein Engineering 11 1998 613-619

著者名 論文標題
Uo, T. Occurrence Of Pyridoxal 5'-Phosphate-Dependent Serine Racemase in Silkworm, Bombyx mori.
雑誌名 発行年 ページ
Biochem. Biophys. Res. Commun. 246 1998 31-34

著者名 論文標題
Fuchikami, Y. Construction and Properties of a Fragmentary D-Amino Acid Aminotransferase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 124 1998 905-910

著者名 論文標題
Kurokawa, Y. Transamination as a Side-Reaction Catalyzed by Alanine Racemase of Bacillus stearothemophilus.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 124 1998 1163-1169

著者名 論文標題
Li, Y. -F X-Ray Structure of A Reaction Intermediate of L-2-Haloacid Dehalogenase with L-2-Chloropropionamide.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 124 1998 20-22

著者名 論文標題
Nishina, Y. Resonance Raman Study on Reduced Flavin in Purple Intermediate of Flavoenzyme: Use of [4-Carbonyl-18O]-Enriched Flavin.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 124 1998 200-208

著者名 論文標題
Matsuzaki, R. Exploring A Channel to The Active Site of Copper / Topaquinone-Containing Phenylethylamine Oxidase by Chemical.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 37 1998 13947-13957

著者名 論文標題
Oue, S. Redesignning The Substrate Specificity of An Enzyme by Cumulative Effects of The Mutations of Non-Active Site Residues.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 274 1999 2344-2349

著者名 論文標題
Toraya, T. A Reactivating Factor for Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 247 1999 3372-3377

著者名 論文標題
Watanabe, A. Role of Lysine39 of Alanine Racemase from Bacillus Stearothermophilus That Binds Pyridoxal 5'-Phosphate:Chemical Rescue Studies of Lys39→Ala Mutant.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 247 1999 4189-4194

著者名 論文標題
Tamaoki, H. Mechanism for Recognition and Activation of Substrate in Medium-Chain Acyl-CoA Dehydrogenase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 125 1999 285-296

著者名 論文標題
Odagaki, Y. Crystal Structure of The Pyroglutamyl Peptidase I from Bacillus amyloliquefaciens Reveals New Structure for A Cysteine Protease
雑誌名 発行年 ページ
Structure 7 1999 399-411

著者名 論文標題
Galkin, A. Cold-Adapted Alanine Dehydrogenases from Two Antarctic Bacterial Strains: Gene Cloning. Protein Characterization, and Comparison with Mesophilic and Thermophilic Counterparts.
雑誌名 発行年 ページ
Appl. Environ. Microbiol. 65(9) 1999 4014-4020

著者名 論文標題
Mihara, H. AnifS-like Gene, csdB, Encodes an Escherichia coli Counterpart of Mammalian Selenocysteine Lyase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 274(21) 1999 14768-14772

著者名 論文標題
Watanabe, A. Tyrosine 265 of Alanine Racemase Serves as a Base Abstracting a-Hydrogen from L-Alanine: The Counterpart Residue to Lysine 39 Specific to D-Alanine.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 126(4) 1999 781-786

著者名 論文標題
Tamaoki, H. Mechanism for recognition and activation of substrate in medium-chain acyl-CoA dehydrogenase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 125 1999 285-296

著者名 論文標題
Hirota, S. Spectroscopic Characterzation of Carbon Monoxide Complexes Generated for Copper/Topa Quinone-Containing Amine Oxidases.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 38 1999 14256-14263

著者名 論文標題
谷澤 克行 ビルトイン補酵素−アミノ酸残基に由来する新しい補酵素−
雑誌名 発行年 ページ
蛋白質核酸酵素 44 1999 1947-1958

著者名 論文標題
Yamada, K. Heterologous High-level Expression, Purification, and Enzymological Properties of Recombinant Rat Cobalamin-dependent Methionine Synthase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 274 1999 35571-35576

著者名 論文標題
Mori, K. The Mechanism of Reactivation of Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase by a Molecular Chaperone-Like Reactivating Factor.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 38 1999 13170-13178

著者名 論文標題
Toraya, T. Direct Participaton of Potassium Ion in the Catalysis of Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 126 1999 650-654

著者名 論文標題
Masuda, J. Crystallization and Preliminary X-ray Study of Two Crystal Forms of Klebsiella oxytoca Diol Dehydratase-cyanocobalamin Complex.
雑誌名 発行年 ページ
Acta. Crystallogr. D55 1999 907-909

著者名 論文標題
Shibata, N. A New Mode of B12 Binding and the Direct Particpation of a Potassium Ion in Enzyme Catalysis. X-ray Structure of Diol Dehydratase.
雑誌名 発行年 ページ
Structure 7 1999 997-1008

著者名 論文標題
Tobimatsu, T. Identification and Expression of the Genes Encoding a Reactivating Factor for Adenosylcobalamin-dependent Glycerol Dehydratase.
雑誌名 発行年 ページ
J. Bacter. 181 1999 4410-4113

著者名 論文標題
Oikawa, T. Production of D-Glutamate from L-Glutamate with Glutamate Racemase and L-Glutamate Oxidase.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 63 1999 2168-2173

著者名 論文標題
Oikawa, T. Stereoisomers of Glutathione: Preparation and Enzymatic Reactivities.
雑誌名 発行年 ページ
J. Nutr. Sci. Vitaminol. 45 1999 223-229

著者名 論文標題
Nakai, T. Structure of Thermus thermophilus HB8 Aspartate Aminotransferase and Its Complex with Maleate.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 38(8) 1999 2413-2424

著者名 論文標題
Hoseki, J. Directed Evolution of Thermostable Kanamycin-Resistant Gene Products in an Extremely Thermophilic Bacterium, Thermus thermophilus.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 126(5) 1999 951-956

著者名 論文標題
Hayashi, H. Acid-Base Chemistry of the Reaction. of Aromatic L-Amino Acid Decarboxylase and Dopa Analyzed by Transient and Steady-State Kinetics: Preferential Binding of the Substrate with Its Amino Group Unprotonated.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 38 1999 15615-15622

著者名 論文標題
Oue, S. Cocrystallization of a Mutant Aspartate Aminotransferase with a C5-Dicarboxylic Substrate Analog: Structural Comparison with the Enzyme-C4-Dicarboxylic Analog Complex.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 127 2000 337-343

著者名 論文標題
Koyanagi, T. Molecular Cloning snd Heterologous Expression of Pea Seedling Copper Amine Oxidase.
雑誌名 発行年 ページ
Biosci. Biotech. Biochem. 64 2000 717-722

著者名 論文標題
Mihara, H. Kinetic and mutational studies of three Nifs homologs from Escherichia coli : Mechanistic difference between L-cysteine desulfurase and L-selenocysteine lyase reactions.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 127(2) 2000 559-567

著者名 論文標題
Mihara, H. cDNA cloning, purification, and characterization of mouse liver selenocysteine lyase. Condidate for selenium delivery protein in selenoprotein synthesis.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 275(9) 2000 6195-6200

著者名 論文標題
Fujii, T. Structure of Nifs homologue: X-ray structure analysis of Csd B, an Escherichia coli counterpart of mammalian selenocysteine lyase.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 39(6) 2000 1263-1273

著者名 論文標題
Gutierrez, A. Modulation of activity and substrate specificity by modifying the backbone length of the distant interdomain loop of D-amino acid aminotransferase.
雑誌名 発行年 ページ
Eur. J. Biochem. 267(24) 2000 7218-7223

著者名 論文標題
Nakai, T. Three dimensional structure of 4-amino-4-deoxychorismate lyase from Escherichia coli.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 128 2000 29-38

著者名 論文標題
Ishijima, J. Free energy requirement for domain movement of enzyme.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 275(25) 2000 18939-18945

著者名 論文標題
Matsui, I. The molecular structure of hyperthermostable aromatic aminotransferase with novel substrate specificity from Pyrococcus horikoshii.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biol. Chem. 275(7) 2000 4871-4879

著者名 論文標題
Mizutani, H. Three-dimensional structure of the purple intermediate of porcine kidney D-amino acid oxidase. Optimization of the oxidative half-reaction through alignment of the product with reduced flavin.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 128 2000 73-81

著者名 論文標題
Toraya, T. Radical atalysis of B12 enzymes: structure, mechanism, inactivation and reactivation of diol and glycerol dehydratasesm.
雑誌名 発行年 ページ
Cell. Mol. Life Sci. 57 2000 106-127

著者名 論文標題
Masuda, J. How a grotein generates a catalytic radical from coenzyme B12 : X-ray structure of a diol - dehydratase - adeninylpentylcobalamin Complex.
雑誌名 発行年 ページ
Structure 8 2000 775-788

著者名 論文標題
Tobimatsu, T. Specificities of reactivating factors for adenosylcoblamin - dependent diol dehydratase and glycerol dehydratase.
雑誌名 発行年 ページ
Arch. Microbiol. 174 2000 81-88

著者名 論文標題
Nishina, Y. Substrate recognition and activation mechanism of D-amino acid oxidase : A study using substrate analogs.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 128 2000 213-223

著者名 論文標題
M. M. Islam The substrate activation process in the catalytic reaction of Escherichia coli aromatic amino acid aminotransferase.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 39(50) 2000 15418-15428

著者名 論文標題
鏡山 博行 立体構造をもとにしたトランスアミナーゼの研究
雑誌名 発行年 ページ
ビタミン 74(1) 2000 1-12

著者名 論文標題
Ura, H. Temperature dependence of the enzyme - substrate recognition mechanism.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 129(1) 2001 173-178

著者名 論文標題
Mizuguchi, H. Strain is more important than electrostatic interaction in controlling the pKa of the catalytic group in aspatate aminotransferase.
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 40 2001 353-360

著者名 論文標題
Miura, R. Porcine kidney D-amino acid oxidase : The three dimensional structure and its catalytic mechanism based on the enzyme - substrate complex model.
雑誌名 発行年 ページ
J. Mol. Catalysis. B, Enzymatic 12 2001 43-52

著者名 論文標題
Haruyama, K. Structure of Escherichia coli histidinol - phosphate aminotransferase and its complexes with histidinol - phosphate and N-(5'-phosphopyridoxyl)-L-glutamate double substrate recognition of the enzyme
雑誌名 発行年 ページ
Biochemistry 40 2001 in press

著者名 論文標題
Miura, R. Versatility and specificity of flavoenzymes : Control mechanism of flavin reactivity.
雑誌名 発行年 ページ
The Chemical Record 1 2001 in press

著者名 論文標題
Watanabe, A. Stereochemistry of the hydrogen abstraction from pyridoxamine phosphate catalyzed by alanine racemase of Bacillus stearothermophilus.
雑誌名 発行年 ページ
J. Mol. Catalysis   2001 in press

著者名 論文標題
Eda, M. Theoretical Predictions on the Mechanism of Catalysis of Coenzyme B12 - Dependent Diol.
雑誌名 発行年 ページ
Dehydratase   2001 in press

著者名 論文標題
Oikawa, T. Fragmentary form of thermostable leucine dehydrogenase of Bacillus stearothermophilus: Its construction and reconstruction of active fragmentary enzyme.
雑誌名 発行年 ページ
Biochem. Biophys. Res. Commun   2001 in press

著者名 論文標題
Oikawa, T. Alanine aminotransferase II from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus sp. TK1: Purification, molecular characterization, and expression in Escherichia coli.
雑誌名 発行年 ページ
Eur, J. Biochem.   2001 in press

著者名 論文標題
Oikawa, T. Psychrophilic valine dehydrogenase of Antarctic Psychophile, Cytophaga sp. P1: Purification, molecular characterization, and expression in Escherichia coli.
雑誌名 発行年 ページ
Eur. J. Biochem.   2001  

著者名 論文標題
Kazuoka, T. Thermostable alcohol dehydrogenase from a Psycophile, Cytophage sp. KUC-1: Cloning, molecular characterization.
雑誌名 発行年 ページ
Proc. Natl. Acad. Sci. USA   2001 in press

著者名 論文標題
Oikawa, T Alanine aminotransferase I from the hyperthermophilic Archaeon Thermococcus sp. TK1: Purification, molecular characterization, and expression in Escherichia coli.
雑誌名 発行年 ページ
Eur. J. Biochem.   2001 in press

著者名 論文標題
Jhee, K. -H. Stereochemistry of the transamination reaction catalyzed by aminodeoxychorismate lyase from Escherichia coli: Close relationship between fold type and stereochemistry.
雑誌名 発行年 ページ
J. Biochem. 128(4) 2000 679-686

[図書]
著者名 出版者
Miura, R. Agency for Scientific Publ., Berlin.
書名 発行年 総ページ数
Flavins and Flavoproteins 1999 939

著者名 出版者
Setoyama, C. Agency for Scientific Publ., Berlin.
書名 発行年 総ページ数
Flavins and Flavoproteins 1999 939

著者名 出版者
Kagamiyama, H. Academic Press
書名 発行年 総ページ数
Methodes in Enzymology (Branched. chain amino acid aminotransferase in E. coli) 2000 550

著者名 出版者
Hayashi, H. Birkhauser Verlag
書名 発行年 総ページ数
Biochemistry and Molecular Bioligy of Vitamin B6 and PQQ - dependent proteins 2000 376

著者名 出版者
Hirotsu, K. Birkhauser Verlag
書名 発行年 総ページ数
Biochemistry and Molecular Biology of Vitamin B6 and PQQ - dependent proteins. 2000 376


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